随着六横经济的发展，岛内现有污水处理能力已无法满足日常污水处理需求，同时随着浙江省《关于推进城镇污水处理厂清洁排放标准技术改造指导意见》的颁布和实施，全省正有序推进城镇污水处理厂清洁排放技术改造，以满足DB33/2169-2018《城镇污水处理厂主要水污染物排放标准》，因此，建设单位开展六横镇城镇污水处理厂二期工程，新增0.9万m³/d的处理能力，总处理能力达1.8万m³/d，同时对整体进行提标改造，出水达到GB18918-2002《城镇污水处理厂污染物排放标准》一级A标准，主要指标（COD_Cr、氨氮、总氮、总磷）达到DB33/2169-2018《城镇污水处理厂主要水污染物排放标准》表1现有城镇污水处理厂主要水污染物排放限值要求。

舟山市普陀区六横镇人民政府于2019年9月委托浙江同源环保科技有限公司编制了《舟山市普陀区六横镇城镇污水处理厂二期建设及整体提标改造项目环境影响报告表》，舟山市生态环境局普陀分局于2021年9月23日对该项目进行了审查批复，同意项目开工建。

舟山市普陀区六横镇城镇污水处理厂二期建设及整体提标改造项目于2022年2月15日开工建设，于2023年4月投入调试，2023年4月进入验收阶段。